四川高职医学院拥有多个系别，包括：
临床医学系
该系为学生提供临床医学相关的课程，培养学为具备扎实医学理论知识和临床实践能力的医学专业人才。
护理系
护理系为学生提供护理学专业的教育培训，帮助学生掌握护理技能和专业知识，培养学为具有护理实践能力和创新精神的护理专业人才。
医学影像系
该系为学生提供医学影像学专业的教育培训，帮助学生掌握医学影像技术和专业知识，培养学为具有医学影像技术操作能力和临床应用能力的医学影像专业人才。
口腔医学系
口腔医学系为学生提供口腔医学专业的教育培训，帮助学生掌握口腔医学理论知识和临床技能，培养学为具有口腔医学临床实践能力和科研能力的口腔医学专业人才。
药学系
药学系为学生提供药学专业的教育培训，帮助学生掌握药学知识和技能，培养学为具有药学研究和临床应用能力的药学专业人才。
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